Attraverso l’adesione l’azienda accantona presso Fondimpresa in un proprio conto individuale denominato "conto formazione", una quota pari al 70% del contributo obbligatorio dello 0,30% sulle retribuzioni dei propri dipendenti versato al Fondo tramite l'INPS.

Le risorse accantonate sono a completa disposizione dell'azienda titolare, che può utilizzarle per fare formazione ai propri dipendenti nei tempi e con le modalità che ritiene più opportuni, sulla base di Piani formativi aziendali o interaziendali condivisi dalle rappresentanze delle parti sociali.

Le risorse del "conto formazione" possono finanziare fino ai due terzi della spesa complessiva di ciascun Piano formativo, mentre il restante terzo resta a carico dell'impresa titolare e può essere coperto con la spesa sostenuta per i propri dipendenti in relazione alle ore di partecipazione alle attività di formazione.

Inoltre Fondimpresa mette a disposizione delle aziende aderenti anche le risorse acccantonate nel “conto di sistema” ossia un conto collettivo costituito utilizzando il 26% dei contributi versati a Fondimpresa dalle imprese aderenti. Esso ha l'obiettivo di favorire lo sviluppo di Piani formativi che coinvolgono e aggregano le imprese aderenti su tematiche e/o azioni formative di interesse comune, in ambito territoriale o settoriale, sostenendo in particolare le aziende di minori dimensioni e i territori più deboli.
Fondimpresa per garantire la massima informazione e pari opportunità di accesso a tutte le aziende mette a disposizione delle imprese aderenti le risorse del "conto di sistema" attraverso degli avvisi pubblici. Nel 2007 sono già stati  pubblicati 2 avvisi: